Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TLR1Q15399 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms