Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERBB4Q15303 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms