Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKD1Q15139 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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