Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BRD3Q15059 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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BRD3Q15059 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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BRD3Q15059 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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BRD3Q15059 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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BRD3Q15059 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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BRD3Q15059 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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BRD3Q15059 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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BRD3Q15059 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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BRD3Q15059 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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BRD3Q15059 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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