Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHD4Q14839 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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CHD4Q14839 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CHD4Q14839 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CHD4Q14839 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CHD4Q14839 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHD4Q14839 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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