Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
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GBX1Q14549 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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GBX1Q14549 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GBX1Q14549 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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