Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM25Q14258 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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