Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM53BQ14153 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM53BQ14153 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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