Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDH18Q13634 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms