Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms