Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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