Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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