Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MSLNQ13421 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MSLNQ13421 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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