Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ITGB3BPQ13352 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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