Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATMQ13315 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATMQ13315 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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