Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RIGQ13278 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RIGQ13278 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RIGQ13278 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RIGQ13278 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RIGQ13278 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RIGQ13278 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RIGQ13278 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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