Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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