Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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IFT88Q13099 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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IFT88Q13099 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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IFT88Q13099 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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IFT88Q13099 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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IFT88Q13099 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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IFT88Q13099 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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IFT88Q13099 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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IFT88Q13099 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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IFT88Q13099 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT88Q13099 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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