Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FOXD4Q12950 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FOXD4Q12950 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FOXD4Q12950 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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