Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHD3Q12873 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHD3Q12873 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHD3Q12873 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHD3Q12873 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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CHD3Q12873 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHD3Q12873 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD3Q12873 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD3Q12873 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD3Q12873 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD3Q12873 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD3Q12873 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHD3Q12873 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD3Q12873 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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CHD3Q12873 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD3Q12873 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHD3Q12873 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD3Q12873 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHD3Q12873 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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CHD3Q12873 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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CHD3Q12873 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CHD3Q12873 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHD3Q12873 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CHD3Q12873 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD3Q12873 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD3Q12873 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD3Q12873 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD3Q12873 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD3Q12873 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHD3Q12873 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHD3Q12873 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHD3Q12873 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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