Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms