Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM27E3Q08E93 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms