Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD47Q08722 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD47Q08722 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD47Q08722 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD47Q08722 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD47Q08722 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD47Q08722 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms