Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms