Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms