Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DEUP1Q05D60 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms