Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NRG1Q02297 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms