Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDC42EP1Q00587 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms