Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FAM3AP98173 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FAM3AP98173 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FAM3AP98173 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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FAM3AP98173 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM3AP98173 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM3AP98173 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM3AP98173 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM3AP98173 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM3AP98173 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM3AP98173 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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