Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SKOR1P84550 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms