Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITX1P78337 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITX1P78337 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms