Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms