Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UFM1P61960 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UFM1P61960 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UFM1P61960 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms