Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2NP61088 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms