Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC00313P59037 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms