Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA9P57773 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJA9P57773 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJA9P57773 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJA9P57773 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJA9P57773 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA9P57773 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA9P57773 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA9P57773 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA9P57773 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA9P57773 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA9P57773 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA9P57773 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJA9P57773 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms