Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIK1P57059 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIK1P57059 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIK1P57059 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms