Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP9P55211 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP9P55211 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP9P55211 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP9P55211 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP9P55211 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP9P55211 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP9P55211 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP9P55211 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP9P55211 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms