Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAD23AP54725 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms