Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOSBP53539 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOSBP53539 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOSBP53539 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOSBP53539 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOSBP53539 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOSBP53539 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOSBP53539 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOSBP53539 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOSBP53539 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOSBP53539 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms