Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTDSS1P48651 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms