Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP3P42574 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP3P42574 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP3P42574 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms