Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms