Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms