Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTNNB1P35222 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTNNB1P35222 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms