Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYKP34925 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYKP34925 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYKP34925 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms