Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC1P33527 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms