Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCKARP32238 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms