Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB4P30926 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB4P30926 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms