Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TSPOP30536 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TSPOP30536 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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